Les institutions sont confrontées à un certain nombre de défis lors de la mise en oeuvre des contrôles internes, comme les problèmes de liquidités, les rapports qui ne sont pas présentés en temps voulu, l'absence de responsabilité pour les ressources, les fraudes et l'utilisation abusive des ressources institutionnelles. Cette étude est confrontée au défi de ne pas être performante compte tenu du caractère unique de chaque organisation. Cette étude avait pour objectif général d'évaluer l'effet de l'audit interne sur la performance d'une organisation. Les objectifs spécifiques sont : identifier les pratiques d'audit interne utilisées dans la paroisse de Compassion Rwanda byimana, évaluer le niveau de performance de la paroisse de Compassion Rwanda byimana, et évaluer la relation entre l'audit interne et la performance de la paroisse de Compassion Rwanda byimana. Cette étude a été réalisée dans la paroisse de Compassion Rwanda Byimana, sur une population de 15 employés, qui sont en même temps le répondant. Les données ont été collectées à l'aide d'un questionnaire, et interprétées à l'aide des tableaux de SPSS version 16. Les résultats montrent que : 100% des répondants sont tout à fait d'accord pour dire qu'ils ont un audit interne fort.